המשרד להגנת הסביבה הוקם בשנת 1989 בהחלטת ממשלה מס` 5 מיום 25/12/1988. המשרד פועל בשלוש רמות: ארצית, מחוזית ומקומית. ברמה הארצית: נושא המשרד באחריות לניסוחה של מדיניות ארצית משולבת וכוללנית, וכן לפיתוח אסטרטגיות, תקנים וקדימויות להגנת הסביבה. במישור זה פועלים במשרד אגפים ומחלקות העוסקים בטיפול בנושאים הסביבתיים המקצועיים, במנגנון האדמיניסטרטיבי ובקשרי גומלין עם האזרח.